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结肠内阿米巴（Entamoeba coli Grassi，1879）是人体肠道最常见的共栖原虫，不致病。胞质呈颗粒状，内外质不分明，活动迟缓。内质含大量细菌、酵母菌及淀粉粒等食物泡，但不含红细胞。具有鉴别意义的核，经铁素木素染色后可见核周染粒粗细不匀，排列不齐，核仁稍大，经常偏位。呈世界性分布，在我国与溶组织内阿米巴平行分布，感染率高于后者。发现结肠内阿米巴时有必要继续寻找痢疾阿米巴。