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苗药主要分布于苗族聚居的苗岭山脉、乌蒙山脉及武陵山脉等地区。由于各地区纬度、地理环境、用药习惯的不同，各类药物分布有差异，有的种类如：见血飞、鱼腥草、银花、桔梗等几乎各地都有分布；而有的种类如：艾纳香、马槟榔、金铁锁、松萝、紫金莲等仅限于某些地区和一定的海拔高度才有分布。近年来，我国苗族聚居的广大地区建立了不少的药材种植生产基地，大力开发常用的药材如天麻、茯苓、杜仲等的人工栽培。